Para os biólogos e estudiosos da área, a origem das cobras continua ainda a ser uma questão não resolvida. Há duas hipóteses aceitas como verdadeiras, e ambas são possíveis baseadas no corpo do animal e em como ele teria se tornado o que é hoje, já que toda espécie vive passa ao longo dos tempos por um processo de evolução.
A cobra seria uma evolução do lagarto
Há evidências fósseis que embasam a teoria de que as cobras podem ter evoluído dos lagartos do tipo escavadores durante o período histórico conhecido como Cretáceo. Um fóssil de cobra chamado de Najash rionegrina era um animal com duas pernas com um sacro e totalmente terrestre. Segundo os estudos, um sobrevivente desse ancestral seria o monitor Lanthanotus de Borneo.
Os pesquisadores concluíram que as espécies evoluíram seus corpos para algo mais simplificado para se esconder e não precisavam das patas, o que resultou na perda de seus membros. De acordo com esta hipótese, recursos como os pálpebras fundidas e transparentes e orelhas externas evoluíram para lidar com dificuldades de viver dentro da terra, já que haveria arranhões nas córneas e sujeira nas orelhas. As pesquisas indicam que as cobras primitivas tinham membros posteriores, mas seus ossos pélvicos não tinham uma conexão direta com as vértebras.
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